1845 tötet der junge James den Hausmeister seines Elternhauses, Thomas Logan, als dieser James' Vater tötet. Der Junge ersticht Thomas mit Klauen, die aus seinen Knöcheln kommen – James ist ein Mutant. Thomas offenbart dem Jungen, dass er sein Vater ist. Daraufhin flieht James gemeinsam mit Thomas' Sohn, also seinem Halbbruder, Victor.

Die beiden kämpfen im nächsten Jahrhundert als Soldaten im Amerikanischen Bürgerkrieg, den beiden Weltkriegen und dem Vietnamkrieg. 1975 sollen die beiden hingerichtet werden, als Victor einen Offizier tötet – sie überleben den Kugelhagel jedoch.

Major William Stryker rekrutiert die beiden Mutanten für das 'Team X' - einer Sondereinheit bestehend aus Mutanten. Als die Einheit immer brutaler vorgeht und unschuldige Leben geopfert werden, steigt James aus. Sechs Jahre später lebt James unter dem Pseudonym Logan in Kanada, wo er als Holzfäller arbeitet. Er führt ein einfaches, glückliches Leben mit seiner Freundin Kayla. Doch sein Frieden wird gestört, als Stryker ihn aufsucht, weil er seine Hilfe braucht. Er berfürchtet, dass Victor sich an den ehemaligen Teammitgliedern rächen will. Logan verwehrt seine Hilfe.

Kurz darauf findet er Kayla blutüberströmt im Wald. Sie ist tot und Logan glaubt, Victor sei der Täter. Um sich richtig rächen zu können, bietet Stryker Logan an, seine Knochen mit dem unzerstörbaren Metall Adamantium zu überziehen – so ist er unbesiegbar. Nach der Prozedur will Stryker jedoch Logans Gedächtnis auslöschen, um ihn als Söldner zu benutzen. Logan flieht und will endlich Rache.